靶向蛋白質(zhì)降解領(lǐng)域的最新進(jìn)展與前景
前言
靶向蛋白質(zhì)降解(TPD)是一種新興的治療方法,因其在治療上可以調(diào)節(jié)傳統(tǒng)小分子難以靶向的蛋白質(zhì)而備受關(guān)注。降解劑可以將小分子抑制劑的口服生物利用度和易制備性與RNA干擾等更復(fù)雜模式的有利特性相結(jié)合。通過(guò)去除蛋白質(zhì),它們中斷了直接(如酶促)和輔助(如支架)功能,擴(kuò)大了可藥用蛋白質(zhì)組,并有可能提高療效。
自從首次報(bào)道了利用泛素-蛋白酶體系統(tǒng)降解靶蛋白的PROTAC分子概念以來(lái)的20年里,TPD已經(jīng)從學(xué)術(shù)界轉(zhuǎn)移到工業(yè)界,許多公司已經(jīng)啟動(dòng)了臨床前和早期臨床開(kāi)發(fā)的計(jì)劃。2019年,第一批PROTAC分子進(jìn)入臨床試驗(yàn);2020年,針對(duì)雌激素受體(ER)和雄激素受體(AR)癌癥靶點(diǎn)的PROTAC臨床概念得到證明。有了這一成功,目前,TPD領(lǐng)域現(xiàn)在已經(jīng)準(zhǔn)備好并致力于攻克那些被認(rèn)為“不可成藥”的靶點(diǎn)。
TPD的類(lèi)型和機(jī)制
目前的TPD可以分為三大類(lèi):分子膠、異雙功能降解劑和選擇性雌激素受體降解劑(SERD)。
分子膠是在其機(jī)制清楚之前偶然發(fā)現(xiàn)的,是最小、最簡(jiǎn)單的,具有優(yōu)異的藥物特性。它們與E3連接酶結(jié)合,重塑其表面以與靶蛋白相互作用,并標(biāo)記其進(jìn)行蛋白酶體降解。由于分子膠依賴(lài)于許多弱相互作用,因此很難合理設(shè)計(jì),而發(fā)現(xiàn)依賴(lài)于表型篩選和降解蛋白質(zhì)的測(cè)定。
異雙功能降解劑,如蛋白水解靶向嵌合體(PROTAC),功能相似,其具有“啞鈴”結(jié)構(gòu):一端招募E3連接酶,另一端結(jié)合靶標(biāo),接頭確保適當(dāng)?shù)南嗷プ饔。它的作用機(jī)理非常簡(jiǎn)單,就是首先把目標(biāo)蛋白和E3連接酶連在一起。這個(gè)三元復(fù)合物形成以后,泛素酶就會(huì)自動(dòng)轉(zhuǎn)移到目標(biāo)蛋白上,然后蛋白酶體通過(guò)識(shí)別目標(biāo)蛋白上的泛素酶來(lái)靶向降解目標(biāo)蛋白。
SERD只影響雌激素受體:它們?nèi)〈萍に亟Y(jié)合,并引發(fā)不穩(wěn)定的構(gòu)象變化,從而招募E3連接酶。SERD目前只應(yīng)用于癌癥治療。
TPD的研發(fā)趨勢(shì)
TPD領(lǐng)域目前包括5個(gè)已批準(zhǔn)上市的藥物、58個(gè)處于臨床階段的藥物和約200多個(gè)臨床前的管線。
腫瘤之外的應(yīng)用
雖然所有批準(zhǔn)的和90%臨床階段的靶向蛋白降解藥物都在腫瘤學(xué)領(lǐng)域,但它們也在其他具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)的治療領(lǐng)域取得進(jìn)展,如神經(jīng)病學(xué)和免疫學(xué)。目前,有11%的研發(fā)管線應(yīng)用于神經(jīng)學(xué),6%應(yīng)用于免疫學(xué),如雙功能降解劑(ARV-102、KT-474)和分子膠(BMS-986419、MRT-6160)。
靶向不可成藥的靶標(biāo)
TPD發(fā)展的第一波浪潮側(cè)重于低風(fēng)險(xiǎn)、常用藥物的靶點(diǎn)(如ER、雄激素受體和BTK)。然而,下一波發(fā)展的重點(diǎn)是更具創(chuàng)新性的靶點(diǎn),70%的研發(fā)管線靶向調(diào)節(jié)“不可成藥”的蛋白,包括Tau、SMARCA2和GSPT1等。
PROTAC及其新一代變體
PROTAC目前占TPD研發(fā)管線中的一半以上(64%),由于其模塊化設(shè)計(jì)、靶點(diǎn)驅(qū)動(dòng)的發(fā)現(xiàn)和臨床療效提高的早期證據(jù),也是下一代技術(shù)的基礎(chǔ)。然而,其潛在的安全性、有效性和疾病適用性障礙可能會(huì)限制其發(fā)展,如脫靶蛋白的降解、耐藥性突變。此外,目前這一代降解劑不能靶向細(xì)胞外蛋白,如細(xì)胞因子和生長(zhǎng)因子。下一代降解劑旨在通過(guò)配體、通路、遞送和激活方面的進(jìn)步來(lái)克服這些局限性。
下一代TPD的創(chuàng)新
下一代蛋白降解藥物的關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新包括:
配體創(chuàng)新
E3連接酶和POI的新配體提供了擴(kuò)大可選擇靶點(diǎn)和提高組織特異性的途徑,從而提高了疾病的適用性和安全性。替代性E3連接酶招募結(jié)構(gòu)域,如使用在腫瘤中過(guò)表達(dá)的HSP90伴侶復(fù)合物介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解劑(CHAMP),或組織/腫瘤特異性E3連接酶,可以限制TPD對(duì)癌細(xì)胞的活性并減少脫靶效應(yīng)。此外,替代POI配體部分可以將覆蓋范圍擴(kuò)展到更多種類(lèi)的“不可成藥”靶標(biāo);例如RNA-PROTAC使用短寡核苷酸來(lái)降解核糖核蛋白。
通路創(chuàng)新
泛素-蛋白酶體系統(tǒng)的替代途徑可以擴(kuò)大可選擇靶點(diǎn)并克服E3連接酶耐藥性。細(xì)胞外蛋白的分子降解劑(MoDE)和溶酶體靶向嵌合體(LYTAC)使用內(nèi)體-溶酶體途徑,將范圍擴(kuò)展到細(xì)胞外蛋白。自噬靶向嵌合體(AUTACs)利用自噬溶酶體途徑,為細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)和細(xì)胞器提供了一種E3連接酶非依賴(lài)性途徑。
遞送創(chuàng)新
TPDs可以利用抗體偶聯(lián)物(DAC)、納米技術(shù)(Nano-PROTACs)和點(diǎn)擊化學(xué)(CLIPTACs)的進(jìn)步來(lái)提高特異性和效力。DAC可以識(shí)別靶細(xì)胞上表達(dá)的受體,納米PROTAC可以對(duì)腫瘤特異性條件做出反應(yīng),從而將PROTAC集中遞送到癌細(xì)胞。CLIPTACs以?xún)蓚(gè)較小的片段遞送,可以自組裝,從而提高口服生物利用度。
激活創(chuàng)新
靶向激活可以控制空間和時(shí)間的降解,無(wú)論是對(duì)光(PHOTAC)、低氧(缺氧激活的PROTAC)還是額外的POI(三價(jià)PROTACs)的反應(yīng)。然而,這些方法面臨著實(shí)際的限制:光的有限組織穿透限制了PHOTAC的激活;自然缺氧組織限制了缺氧激活的PROTAC對(duì)腫瘤的特異性;額外增加的體積可能會(huì)限制三價(jià)PROTAC的口服生物利用度。
小結(jié)
在過(guò)去的20多年中,TPD作為藥物研發(fā)的一個(gè)前沿技術(shù)正在飛速發(fā)展之中,尤其在過(guò)去的幾年,PROTAC已經(jīng)成為一種關(guān)鍵的治療方式。最近,通過(guò)I期和II期臨床試驗(yàn)中的陽(yáng)性結(jié)果,也讓我們看到了PROTAC在腫瘤和其它疾病中巨大的治療潛力。TPD可布局的靶點(diǎn)廣闊,市場(chǎng)巨大,相信隨著該技術(shù)的不斷進(jìn)步和完善,相信TPD可以成為像小分子抑制劑、單抗和免疫治療等一樣成功的療法,使更多的疾病患者從中受益。
參考文獻(xiàn):
1.Thetargeted protein degradation landscape. Nat Rev Drug Discov.2024 Nov 27.
2. PROTAC targeted protein degraders: the pastis prologue. Nat Rev Drug Discov. 2022 Jan 18 : 1–20.
原文標(biāo)題 : 靶向蛋白質(zhì)降解領(lǐng)域的最新進(jìn)展與前景

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