《Nature》:海洋微生物通過共生合作,合成維生素B12
01
文章背景簡介
BACKGROUND INTRODUCTION
維生素B12(VitaminB12)是一種含鈷的水溶性維生素,廣泛應(yīng)用于飼料和食品、保健和醫(yī)療行業(yè)。廣義上,維生素B12是指一組含鈷化合物(即鈷胺素),包括氰鈷胺、腺苷鈷胺素、羥鈷胺素和甲基鈷胺素等,狹義上,通常說的的維生素B12是氰鈷胺維生素B12的簡稱,維生素B12衍生物則包括:腺苷鈷胺素、羥鈷胺素和甲基鈷胺素等。而維生素B12又分為醫(yī)藥級(jí)、食品級(jí)和飼料級(jí)。氰鈷胺維生素B12一般是指醫(yī)藥級(jí)維生素B12,維生素B12衍生物都一般都是醫(yī)藥級(jí),用于藥品。維生素B12主要參與制造骨髓紅細(xì)胞,具有防止惡性貧血、防止大腦神經(jīng)受到破壞等作用,臨床主要用于治療巨幼紅細(xì)胞性貧血等疾病,也有報(bào)道顯示可用于治療前列腺癌及多發(fā)性硬化癥等。
我國最早于1966年,由華北制藥開發(fā)成功維生素B12,產(chǎn)量一直較小,70年代僅有幾十公斤,到九十年代后引進(jìn)新的菌種后,采用新技術(shù)、新工藝,產(chǎn)量才大幅度上升。隨后又有石藥、寧夏金維、河北玉星等企業(yè)投產(chǎn)維生素B12。根據(jù)貝哲斯咨詢統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù),全球與中國維生素B12市場(chǎng)規(guī)模在近年來持續(xù)增長。2023年,全球維生素B12市場(chǎng)規(guī)模達(dá)到了30.94億元(人民幣),而中國市場(chǎng)規(guī)模為13.21億元。預(yù)計(jì)到2029年,全球維生素B12市場(chǎng)規(guī)模將以6.24%的增速達(dá)到44.24億元(維生素B12的前沿研究,及市場(chǎng)規(guī)模)。
維生素B12是唯一含有金屬元素的維生素,其分子的核心是一個(gè)與鈷離子配位的咕啉環(huán)結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)極其復(fù)雜,咕啉環(huán)上總共有多達(dá)9個(gè)手性碳原子,化學(xué)合成難度很高。而在生物合成方面,天然的高等動(dòng)植物不能制造維生素B12,自然界中的維生素B12都是微生物合成的,因此目前工業(yè)上維生素B12基本上只通過微生物發(fā)酵生產(chǎn),根據(jù)資料顯示,除了目前主流的生產(chǎn)菌費(fèi)氏丙酸桿菌和脫氮假單胞菌外,還有巨大芽孢桿菌、乳桿菌、中華根瘤菌等能產(chǎn)生維生素B12。隨著合成生物學(xué)的快速發(fā)展,通過代謝網(wǎng)絡(luò)的基因編輯,是探索維生素B12高效生物合成的重要策略。
維生素B12分子結(jié)構(gòu)
在海洋生態(tài)系統(tǒng)中,微生物扮演著至關(guān)重要的角色,它們不僅參與了生物地球化學(xué)循環(huán),還影響著全球氣候和生態(tài)平衡。維生素B12(鈷胺素)作為大多數(shù)海洋原核生物和真核生物必需的輔酶,其合成和循環(huán)機(jī)制一直是微生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。然而,維生素B12在自然界中的分布極為有限,特別是在海洋環(huán)境中,其稀缺性對(duì)微生物相互作用和群落動(dòng)態(tài)產(chǎn)生了顯著影響。為了深入探索這一復(fù)雜的生態(tài)現(xiàn)象,德國Oldenburg大學(xué)的Gerrit Wienhausen等人在《Nature》(IF50.5,綜合類一區(qū))雜志上發(fā)表了題為“Ligand cross-feeding resolves bacterial vitamin B12 auxotrophies”的研究文章,為我們理解海洋微生物如何通過共生合作來合成和共享維生素B12提供了新的視角。
02
所用到的主要方法
METHODS
(1)基因組分析:通過測(cè)序和生物信息學(xué)工具分析微生物的基因組數(shù)據(jù),揭示其生物學(xué)特性和代謝途徑,如維生素B12的合成路徑。
(2)共培養(yǎng)實(shí)驗(yàn):在實(shí)驗(yàn)室條件下同時(shí)培養(yǎng)兩種或多種微生物,研究它們之間的相互作用和共生關(guān)系,揭示微生物如何在自然環(huán)境中合作合成維生素B12。
(3)熒光原位雜交(FISH):利用熒光標(biāo)記的特異性探針檢測(cè)和定位特定的微生物,分析微生物群落結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)。
03
文章主要內(nèi)容摘要
ABSTRACT
維生素B12(鈷胺素)是大多數(shù)海洋原核生物和真核生物的重要輔因子,由數(shù)量有限的原核生物合成,其稀缺性影響了微生物相互作用和群落動(dòng)態(tài)變化。在這項(xiàng)研究中,作者發(fā)現(xiàn)兩種維生素B12營養(yǎng)缺陷型細(xì)菌可以彌補(bǔ)不同的維生素B12構(gòu)建模塊并合作合成維生素B12。一種科爾韋爾氏菌(Colwelliasp.)可以合成并釋放活化的下游配體α-核唑(α-ribazole),該配體被另一種維生素B12營養(yǎng)缺陷型玫瑰變色菌(Roseovariussp.)用來產(chǎn)生咕啉(corrin)環(huán)并合成維生素B12。Roseovariussp.僅在與Colwelliasp.共培養(yǎng)時(shí)才能釋放維生素B12,并且僅在與Roseovariumsp.編碼的原噬菌體的誘導(dǎo)時(shí)同步發(fā)生。在這些條件下,Colwelliasp的后續(xù)生長可能是由于Roseovariusp.裂解細(xì)胞提供了維生素B12。不過,原噬菌體誘導(dǎo)是否是維生素B12釋放的起因,目前還需要進(jìn)一步的證據(jù)來證。在海洋遠(yuǎn)洋生態(tài)系統(tǒng)中,這種配體交叉攝食以及聯(lián)合合成維生素B12的復(fù)雜性微生物相互作用似乎很普遍。在熱帶大西洋西部和北部,預(yù)計(jì)能夠回收鈷啉醇酰胺(cobinamide)并僅合成活化的下游配體的細(xì)菌數(shù)量可能超過了維生素B12的生產(chǎn)菌。這些發(fā)現(xiàn)為我們理解海洋和其他生態(tài)系統(tǒng)中營養(yǎng)缺陷型微生物的B12供應(yīng)增加了新的參考。
簡而言之,本研究的主要內(nèi)容有:
1.細(xì)菌間的配體交叉“飼喂”:Colwelliasp.如何合成并釋放α-核唑(α-ribazole),以及Roseovariussp.如何利用這些配體來合成維生素B12。
2.噬菌體誘導(dǎo)與維生素B12釋放的關(guān)聯(lián)性:Roseovariussp.的噬菌體如何在Colwelliasp.存在時(shí)被誘導(dǎo),以及這如何與維生素B12的釋放相關(guān)聯(lián)。
3.海洋微生物中維生素B12合成潛力的廣泛性:通過分析海洋細(xì)菌基因組,揭示了維生素B12合成潛力在海洋微生物中的分布情況。
原文標(biāo)題 : 《Nature》:海洋微生物通過共生合作,合成維生素B12

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